Originaire de Sicile, il fut le bon pasteur (agathos en grec) qui présida à l'organisation de la jeune Église d'Angleterre, rétablissant l'Orthodoxie de la foi au sixième Concile œcuménique qui refusa l'hérésie monothéliste qui faisait du Christ un dieu par la grâce et non par nature. Les Pères du concile lurent le message de saint Agathon et déclarèrent: "Pierre a parlé par la bouche d'Agathon."
À Rome près de saint Pierre, en 681, la mise au tombeau de saint Agathon, pape, qui défendit l'intégrité de la foi contre les monothélites et promut l'unité de l'Église en plusieurs synodes.
Martyrologe romain
Ermite au désert de Scété, en Egypte (+ 370)
Et ses compagnons martyrs (IVe siècle)